تعداد ۷۸ قطعه سیاه‌ماهی خال‌دار (Capoeta trutta) از چهار رودخانه حوضه بوشهر با استفاده از تور پره به منظور مطالعه تفاوت‌های ریختی صید شد. نمونه­ها بعد از جمع‌آوری و بی‌هوشی با محلول ۱٪ گل‌میخک، در فرمالین 10% تثبیت شدند و برای اندازه­گیری­ها به آزمایشگاه منتقل شدند.   برای آنالیزهای آماری از آزمون­های تحلیل همبستگی کانونی (CVA)، تجزیه به مؤلفه­های اصلی (PCA)، تحلیل خوشه­ای (CA)، تحلیل تابع تشخیصی (DFA)، استفاده شد. آزمون­های PCA، CVA و CA نشان دادند که بین جمعیت­های خیرآباد و فهلیان از حوضه بوشهر و کنجان­چم، دویرج، سیروان، زیمکان، کارون، کرخه و دیره از حوضه دجله در روش ریخت­سنجی هندسی تفاوت معنی­داری (05/0>p) وجود دارد. این نتایج نشان می­دهند که روش­های ریخت­سنجی قادر به تفکیک جمعیت­های مختلف از یکدیگر هستند، اگرچه برای جزئیات بیشتر نیازمند مطالعات مولکولی می­باشد.