با توجه به اهمیت اکولوژیک و شیلاتی تون ماهیان در اکوسیستم منحصر به فرد خلیج فارس، شناخت ذخایر این ماهیان به منظور اعمال مدیریت پایدار شیلاتی ضروری به نظر می رسد. این مطالعه به منظور بررسی ویژگی های رشد و شناسایی ذخایر ماهی زرده (E. Affinis) در آب های استان هرمزگان در سه منطقه قشم، ابوموسی و بندر کلاهی با استفاده از مجموعه ای از خصوصیات ریخت سنجی هندسی و شمارشی صورت گرفت. براساس نتایج به دست آمده، بین طول و وزن ماهی زرده در سه منطقه قشم، ابوموسی و بندر کلاهی همبستگی نسبتاً بالایی وجود داشت. با توجه به مقادیر b به ست آمده از رابطه نمایی طول و وزن مشخص گردید که رشد طولی و وزنی در ماهی زرده در سه منطقه قشم (b=2.8369)، ابوموسی (b=2.5605) و بندر کلاهی (b=2.6456) رشدی آلومتریک و منفی است. مقدار فاکتور وضعیت در کلیه مناطق مورد مطالعه بالای یک بود. نتایج به دست آمده از آنالیز CVA نشان داد که جمعیت ابوموسی و قشم از نظر شکل با هم تفاوت معنی داری داشتند. نتایج Thin plate spline در شبکه تغییر شکل (Deformation grid) بین جمعیت ها نشان داد که بیشترین تغییرات بین لندمارک های تعیین شده به ترتیب در ارتفاع بدن در منطقه شکمی، ارتفاع ساقه د‌می در محل باله دمی، بالچه های مخرجی و طول سر در ناحیه انتهایی سرپوش آبششی ‌می باشد، به طوری که ماهیان منطقه ابوموسی دارای ارتفاع بدن و ساقه د‌می‌ عریض تری نسبت به میانگین کل شکل جمعیت در سه منطقه ‌می باشند. بین ویژگی های شمارشی مطالعه شده در ماهی زرده در سه منطقه مورد مطالعه تفاوت های بسیار اندکی وجود داشت. با این حال تعداد خارهای باله پشتی اول در منطقه قشم به طور معنی داری بیشتر از ابوموسی بود (p<0.05). در مجموع، نتایج این تحقیق نشان داد که ماهی زرده در آب های خلیج فارس در استان هرمزگان دارای تنوع فنوتیپی بالا در بسیاری از ویژگی های مورفومتری بوده و این در حالی است که تنوع بسیار پایینی در ویژگی های مریستیکی وجود دارد. دلیل تنوع فنوتیپی بالای ویژگی های مورفومتری ‌می تواند تفاوت در شرایط زیستی، تولید مثلی، الگوی مهاجرت و حتی شرایط تغذیه ای این ماهی در مناطق مختلف مورد مطالعه باشد.