[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
فرم های ضروری ::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
بایگانی مقالات زیر چاپ::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
نمایه ها

AWT IMAGE

 

 AWT IMAGE

..
:: دوره 8، شماره 4 - ( زمستان-99 1399 ) ::
جلد 8 شماره 4 صفحات 45-36 برگشت به فهرست نسخه ها
مقایسه ژنتیکی ماهی سه خاره (Gasterosteus aculeatus) با استفاده از توالی یابی ژن سیتوکروم اکسیداز (COI) در سواحل جنوبی دریای خزر و شمالی دریای مدیترانه
سیده آیناز شیرنگی*
چکیده:   (2416 مشاهده)
ماهی سه خاره (Gasterosteus aculeatus) یکی از مهمترین گونه­های مدل است که به سادگی در شرایط آزمایشگاهی پرورش می­یابد. با توجه به غیر بومی بودن این گونه در دریای خزر و نامشخص بودن منشا ورود آن و همچنین مجزا بودن جمعیت ماهیان سه خاره جنوب فرانسه در دلتای رودخانه Rhone (تالاب کامارگ) از سایر جمعیت­های اروپا و بویژه مدیترانه، در این تحقیق به مقایسه ژنتیکی ماهیان سه خاره بین خلیج گرگان (سواحل ایران) با تالاب کامارگ (سواحل جنوب فرانسه) با استفاده از توالی یابی ژن COI پرداخته شد. بدین منظور، تعداد 10 قطعه ماهی از هر منطقه نمونه برداری شد و تا زمان انجام آزمایش در الکل اتانول 96% نگهداری شد. پس از استخراج DNA و انجام واکنش PCR با استفاده از یک جفت آغازگر سیتوکروم اکسیداز 1 (COI)، نتایج حاصل از تعیین توالی نشان داد که قطعه تکثیر شده، 680 جفت باز طول دارد. تعداد اندک هاپلوتایپ­ها و تنوع اندک هاپلوتایپ-ها در هر دو منطقه مورد مطالعه نشان دهنده تنوع ژنتیکی پایین در آنها بود. میزان FST به عنوان شاخص تمایز ژنتیکی جمعیت­ها 333/0 بدست آمد که نشاندهنده تمایز بالای دو جمعیت بود. با وجود فاصله ژنتیکی پایین (002/0) بین نمونه­های دو منطقه بر اساس روش دو پارامتر کیمورا (K2P)، ترسیم درخت فیلوژنی نشان داد جمعیت ماهیان سه خاره خلیج گرگان و تالاب کامارگ یک زیر کلید مجزایی را تشکیل دادند. حتی گمان می­رود این دو جمعیت دارای نیای مشترک باشند، اما به دلیل درجه حمایت پایین (بوت استرپ)، روابط بین کلید­ها حل نشد و منشا جمعیت ماهیان خلیج گرگان هم به درستی شناسایی نشد.
واژه‌های کلیدی: ماهی سه خاره، دریای خزر، تالاب کامارگ، سیتوکروم اکسیداز، گونه غیر بومی
متن کامل [PDF 849 kb]   (526 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي
دریافت: 1399/8/29 | پذیرش: 1399/11/3 | انتشار: 1399/11/19
فهرست منابع
1. Alali A. 2007. Morphometric and meristic investigation of Three-spined Stickleback (Gasterosteus aculeatus) in Southwest of Caspian Sea basin. M.Sc. Thesis. Shahid Beheshti University, Tehran. (In Persian)
2. Abdoli A. 1993a. Threespine stickleback in the Caspian Sea. Abzeeyan, 3(10&11):45-45. (In Persian).
3. Abdoli A. 1993b. Three-spined stickleback in southern basins of the Caspian Sea. Abzeeyan, 4(5): 10-13. (In Persian).
4. Ahmadzadeh F., Flecks M., Carretero M. A., Mozaffari O., Bohme W., Harris D.J., Rodder D. 2013. Cryptic speciation patterns in Iranian rock lizards uncovered by integrative taxonomy. PLoS ONE, 8, e80563. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0080563 [DOI:10.1371/journal.pone.0080563.]
5. Araguas R.M., Vidal O., Pla C., Sanz N. 2012. High genetic diversity of the endangered Iberian three-spined stickleback (Gasterosteus aculeatus) at the Mediterranean edge of its range. Freshwater Biology, 57: 143-154. [DOI:10.1111/j.1365-2427.2011.02705.x]
6. Aguesse P., Pruja J.P. 1958. Odonates récoltés par M. Ch. Rungs au Maroc, au Sahara, en Mauritanie et au Sénégal. Comptes Rendus de la Société des Sciences Naturelles et Physiques du Maroc, 24: 103-106. (In French).
7. Avise J.C. 2009. Phylogeography: Retrospect and prospect. Journal of Biogeography, 36: 3-15. [DOI:10.1111/j.1365-2699.2008.02032.x]
8. Bell M.A. 1988. Stickleback fishes: bridging the gap between population biology and paleobiology. Trends in Ecology & Evolution, 3(12): 320-324. [DOI:10.1016/0169-5347(88)90087-0]
9. Bell M.A. 2001. Lateral plate evolution in the threespine stickleback: getting nowhere fast. In: Hendry AP, Kinnison MT (Eds.). Microevolution Rate, Pattern, Process. Springer, Dordrecht, pp. 445-461. [DOI:10.1007/978-94-010-0585-2_27]
10. Bell M.A., Foster S.A. 1994. The evolutionary biology of the threespine stickleback. Journal of Animal Ecology, 64(3): 1-27. [DOI:10.2307/5902]
11. Barrett R.D.H., Paccard A., Healy T.M., Bergek S., Schulte P.M., Schluter D., Rogers S.M., 2011. Rapid evolution of cold tolerance in stickleback. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 278, pp: 233-238. [DOI:10.1098/rspb.2010.0923]
12. Clavero M., Pou Rovira Q., Zamora L. 2009. Biology and habitat use of three- spined stickleback (Gasterosteus aculeatus) in intermittent Mediterranean streams. Ecology of Freshwater Fish, 18(4): 550-559. [DOI:10.1111/j.1600-0633.2009.00369.x]
13. Coad B.W. 2015. Review of the Spiny Eels of Iran (Family Mastacembelidae). Iranian Journal of Ichthyology, 2(1): 1-12.
14. Drevecky C.J., Falco R., Aguirre W.E. 2013. Genetic divergence of a sympatric lake-resident-anadromous three-spined stickleback Gasterosteus aculeatus species pair. Journal of Fish Biology, 83: 111-132. [DOI:10.1111/jfb.12154]
15. Fang B., Merilä J., Ribeiro F., Alexandrec C.M., Momigliano P. 2018. Worldwide phylogeny of three-spined sticklebacks. Molecular Phylogenetics and Evolution, 127: 613-625. [DOI:10.1016/j.ympev.2018.06.008]
16. Fishbase. 2010. www.Fishbase.org:Gasterosteidae
17. Gibson G., 2005. The synthesis and evolution of a supermodel. Science, 307: 1890-1891. [DOI:10.1126/science.1109835]
18. Gharibkhani M. 2014. Genetic analysis of pike-perch, Sander lucioperca L., populations revealed by microsatellite DNA markers in Iran. Caspian Journal of Environmental Sciences, 12(1): 99-108.
19. Ghasemzadeh M. 2006. Morphometric, meristic investgation and Karyotype of Three-spined Stickle-back (Gasterosteus aculeatus) in southeast of Caspian Sea coasts. M.Sc. Thesis. Shahid beheshti University, Tehran.
20. Hebert P.D., Cywinska A., Ball S.L., Waard J.R. 2003. Biological identifications through DNA barcodes Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 270 (1512): 313- 321. [DOI:10.1098/rspb.2002.2218]
21. Hewitt G. 2000. The genetic legacy of the Quaternary ice ages. Nature, 405: 907-913. [DOI:10.1038/35016000]
22. Hubert N., Hanner R., Holm E., Mandrak N.E., Taylor E., Burridge M., Watkinson D., Dumont P., Curry A., Bentzen P., Zhang J., April J., Bernatchez L. 2008. Identifying Canadian Freshwater Fishes through DNA Barcodes. Plos One, 3(6): 1-8. [DOI:10.1371/journal.pone.0002490]
23. Hudson R.R., Slatkin M., Maddison W.P. 1992. Estimation of levels of gene flow from DNA sequence data. Genetics, 132(2): 583-9. [DOI:10.1093/genetics/132.2.583]
24. Izadi S. 2020. Separation of Three-spined Stickleback (Gasterosteus aculateus Linnaeus, 1758) by using Growth rates, Mortality, Molecular and Morphological methods in South Coasts of the Caspian Sea and North Coasts of the Mediterranean Sea. M.Sc. Thesis. University of Gonbad Kavous. (In Persian).
25. Katouzian A.R., Sari A., Macher J.N., Weiss M., Saboori A., Leese F., Weigand A.M. 2016. Drastic underestimation of amphipod biodiversity in the endangered Irano-Anatolian and Caucasus biodiversity hotspots. Scientific Reports, 6, 22507. [DOI:10.1038/srep22507]
26. Lee C.E. 2002. Evolutionary genetics of invasive species. Trends in Ecology & Evolution, 17: 386-391. [DOI:10.1016/S0169-5347(02)02554-5]
27. Lescak E.A., Marcotte R.W., Kenney L.A., von Hippel F.A., Cresko W.A., Sherbick M.L., Colgren J.J., Andrés López, J., Riddle B. 2015. Admixture of ancient mitochondrial lineages in three-spined stickleback populations from the North Pacific. Journl of Biogeography, 42: 532-539. [DOI:10.1111/jbi.12426]
28. Leache A.D., Banbury B.L., Linkem C.W., de Oca A.N.M. 2016. Phylogenomics of a rapid radiation: is chromosomal evolution linked to increased diversification in North American spiny lizards (Genus Sceloporus)?. BMC Evolutionary Biology, 63: 1-16. [DOI:10.1186/s12862-016-0628-x]
29. Leroy S.A., Arpe K. 2007. Glacial refugia for summer-green trees in Europe and south-west Asia as proposed by ECHAM3 time-slice atmospheric model simulations. Journal of Biogeography, 34: 2115-2128. [DOI:10.1111/j.1365-2699.2007.01754.x]
30. Librado P., Rozas J. 2009. DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Genetics and Population Analysis, 25(11): 1451-1452. [DOI:10.1093/bioinformatics/btp187]
31. Mäkinen H.S., Cano J.M., Merilä J. 2006. Genetic relationships among marine and freshwater populations of the European three-spined stickleback (Gasterosteus aculeatus) revealed by microsatellites. Molecular Ecology, 15: 1519-1534. [DOI:10.1111/j.1365-294X.2006.02871.x]
32. Mäkinen H.S., Merilä J. 2008. Mitochondrial DNA phylogeography of the three-spined stickleback (Gasterosteus aculeatus) in Europe-evidence for multiple glacial refugia. Molecular Phylogenetics and Evolution, 46, 167-182. [DOI:10.1016/j.ympev.2007.06.011]
33. McKinnon J.S., Rundle H.D. 2002. Speciation in nature: the threespine stickleback model systems. Trends in Ecology & Evolution, 17: 480-488. [DOI:10.1016/S0169-5347(02)02579-X]
34. McPhail J.D. 1993. Speciation and the evolution of reproductive isolation in the sticklebacks (Gasterosteus) of south-western British Columbia. In: Bell M, Foster S (Eds.). The evolutionary biology of the threespine stickleback. Oxford University Press, UK, pp: 400-437.
35. Orti G., Bell M.A., Reimchen T.E., Meyer A. 1994. Global survey of mitochondrial DNA sequences in the threespine stickleback: evidence for recent migrations. Evolution, 48: 608-622. [DOI:10.1111/j.1558-5646.1994.tb01348.x]
36. Parvizi E., Naderloo R., Keikhosravi A.R., Solhjouy-Fard S., Schubart C.D. 2018. Multiple Pleistocene refugia and repeated phylogeographic breaks in the southern Caspian Sea region: Insights from the freshwater crab Potamon ibericum. Journal of Biogeography, 45(6): 1234-1245. [DOI:10.1111/jbi.13195]
37. Patimar R., Najafabadi M.H., Souraki M. G. 2010. Life history features of the nonindigenous three-spined stickleback (Gasterosteus aculeatus Linnaeus, 1758) in the Gomishan wetland (southeast Caspian Sea, Iran). Turkish Journal of Zoology, 34: 461-470. [DOI:10.3906/zoo-0903-25]
38. Price T.D., Sol D. 2008. Genetics of colonizing species. American Naturalist, 172(S1): S1-S3. [DOI:10.1086/588639]
39. Östlund-Nilsson S. 2006. Reproductive behaviour in the three-spined stickleback. In: Östlund-Nilsson S, Mayer I, Huntingford FA (Eds.). Biology of the Three-Spined Stickleback. Boca Raton: CRC Press, pp: 157-177. [DOI:10.1201/9781420004830.ch5]
40. Rezansoff A.M., Crispo E., Blair C., Cruz E., Kitano J., Vamosi S.M., Rogers S.M. 2015. Toward the genetic origins of a potentially non-native population of threespine stickleback (Gasterosteus aculeatus) in Alberta. Conservation Genetics, 16: 859-873. [DOI:10.1007/s10592-015-0706-4]
41. Rodriguez C.R., Cho E.J, Keogh M.C., Moore C.L., Greenleaf A.L., and Buratowski S. 2000. Kin28, the TFIIH-associated carboxy-terminal domain kinase, facilitates the recruitment of mRNA processing machinery to RNA polymerase II. Molecular and Cellular Biology, 20(1): 104-12 [DOI:10.1128/MCB.20.1.104-112.2000]
42. Sal'nikov V.B. 1995. Possible changes in the composition of the ichthyofauna after completion of the Karakum Canal in Turkmenistan. Journal of Ichthyology, 35(7): 108-121.
43. Sharbati S., Shabani A. 2015. The Effects of Khozeini Canal Reopening on the General Current Pattern in the Gorgan Bay. Joournal of Water and Soil Conservation, 22(3): 241-248.
44. Taggart J. B., Hynes R. A., Prodoehl P. A., Ferguson A. 1992. A simplified protocol for routine total DNA isolation from Salmonid fishes. Journal of Fish Bio- [DOI:10.1111/j.1095-8649.1992.tb02641.x]
45. logy, 40: 619-633.
46. Verhoeven J.T.A. 1980. The ecology of Ruppia-dominated communities in Western Europe, III. Aspects of production, consumption and decom-position. Aquatic Botany, 8: 209-53. [DOI:10.1016/0304-3770(80)90053-4]
47. Watanabe K., Seiichi M., Mutsumi N. 2003. Genetic relationships and origin of two geographic groups of the freshwater threespine stickleback, 'Hariyo'. Zoological science, 20(2): 265-274. [DOI:10.2108/zsj.20.265]
48. Wright S. 1987. Evolution and the genetics of populations, vol. 4: variability within and among natural populations. University of Chicago, Press Chicago. 584 P.
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Shirangi S A. Genetic comparison of Three-spined stickleback (Gasterosteus aculeatus) by using sequencing of Cytochrome Oxidase 1 (COI) gene in the Southern Caspian Sea and the Northern Mediterranean Sea. JAIR 2021; 8 (4) :36-45
URL: http://jair.gonbad.ac.ir/article-1-733-fa.html

شیرنگی سیده آیناز. مقایسه ژنتیکی ماهی سه خاره (Gasterosteus aculeatus) با استفاده از توالی یابی ژن سیتوکروم اکسیداز (COI) در سواحل جنوبی دریای خزر و شمالی دریای مدیترانه. نشریه علمی پژوهشی پژوهشهای ماهی شناسی کاربردی. 1399; 8 (4) :36-45

URL: http://jair.gonbad.ac.ir/article-1-733-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 8، شماره 4 - ( زمستان-99 1399 ) برگشت به فهرست نسخه ها
نشریه علمی پژوهشی پژوهشهای ماهی شناسی کاربردی Journal of Applied Ichthyological Research
Persian site map - English site map - Created in 0.07 seconds with 39 queries by YEKTAWEB 4645