[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
فرم های ضروری ::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
بایگانی مقالات زیر چاپ::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
نمایه ها

AWT IMAGE

 

 AWT IMAGE

..
:: دوره 8، شماره 3 - ( پاییز-99 1399 ) ::
جلد 8 شماره 3 صفحات 26-19 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی ملکولی و DNA بارکدینگ ماهی زمین کن دم نواری (Platycephalus indicus) در سوحل خلیج فارس
سجاد پورمظفر ، سعید تمدنی جهرمی* ، محسن گذری ، حجت الله فروغی فرد ، رقیه آمیز
چکیده:   (2589 مشاهده)
این مطالعه با هدف استفاده از روش بارکدینگ   DNA میتوکندریایی برای حل بهتر مشکلات طبقه بندی گونه ماهی زمین کن دم نواری Platycephalus indus  و ارتباط ژنتیکی با دیگر نمونه های گزارش شده از نقاط مختلف دنیا  و نیز برای مدیریت در بهره برداری بهینه از گونه های بومی و نیز حفظ تنوع زیستی وحفاظت و بهره برداری پایدار از این گونه انجام گردید . نمونه برداری از اب های ساحلی استان هرمزگان بوسیله صید مشتا انجام گرفت . استخراج DNA   با استفاده از کیت و از باله پشتی انجام گردید. روابط فیلوژنتیک Platycephalus indus) ) با استفاده از مقایسه با نمونه های موجود در بانک ژن نشان داد که نمونه بدست آمده از سواحل خلیج فارس در یک کلاید مونوفیلیک و در کلاستر اول در کنار نمونه هایی از چین و عربستان سعودی خود را نشان میدهد.همچنین در این مطالعه مشخص گردید که نمونه مورد مطالعه و دیگر نمونه های گزارش شده از دیگر نقاط دنیا را میتوان با فاصله ژنتیکی بین 002/0 تا 095/0 بترتیب با نمونه عربستان سعودی و چین از یکدیگر تمیز داد که این خود موید تاثیر موثر استفاده از این ژنوم در بارکدینگ و تعیین فاصله ژنتیکی با توجه به تفرق جغرافیایی و همچنین خصوصیات مورفولوژیک میباشد. رسم شبکه هاپلوتایپی گونه های مورد مطالعه نیز بیانگر تفرق هاپلوتایپی نمونه مورد مطالعه نسبت به هاپلوتایپ های دیگر مناطق بود.  همچنین با توجه به داده های بدست آمده می توان استنباط کرد که پراکنش این گونه می تواند تحت تاثیر مهاجرت احتمالی این گونه نیز قرار گیرد.
واژه‌های کلیدی: بارکدینگ، ماهی زمین کن دم نواری، ژن سیتوکرم اکسیداز
متن کامل [PDF 793 kb]   (594 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي
دریافت: 1398/11/16 | پذیرش: 1398/12/3 | انتشار: 1399/11/7
فهرست منابع
1. Bindle H., Forster P., Röhl A. 1999. Median‐joining networks for inferring intraspecific phylogenies. Molecular Biology and Evolution, 16: 37- 48. [DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a026036]
2. Beacham T.D., Lapointe M., Candy J.R., McIn¬tosh B., MacConnachie C., Tabata A., Kaukinen K., Deng L., Miller K.M., Withler R.E. 2004. Stock identification of Fraser River sockeye salm¬on (Oncorhynchus nerka) using microsatellites and major histocompatibility complex variation. Transactions of the American Fisheries Society, 133:1106-1126. [DOI:10.1577/T04-001.1]
3. Bian X.D., Zhang X.M., Gao T.X., Xiao Y.S. 2008. Morphological and genetic identification of Japanese halfbeak (Hyporhamphus sajori) eggs. Journal of Fishery Sciences of China, 32: 342-352.
4. Chang H., Sha X., He G., Song L. 1980. Adscription of the morphological characters of the eggs and larvae of the flathead fish Platycephalus indicus. Journal of Oceanology and Limnology, 11: 161-171.
5. Chen W. 1982. A report on the peculiarities of sexual maturation of flathead fish Platycephalus indicus Linnaeus. Trans. Journal of Oceanology and Limnology, 1: 36-40.
6. Cheng J., Wang Z., Song N. 2019. Phylogeographic analysis of the genus Platycephalus along the coastline of the northwestern Pacific inferred by mitochondrial DNA. BMC Evolutionary Biology, 19(159): 2-16. [DOI:10.1186/s12862-019-1477-1]
7. Domingues R.R., Amorim A.F., Hilsdorf A.W.S. 2013. Genetic identification of Carcharhinus sharks from the southwest Atlantic Ocean (Chondrichthyes: Carcharhiniformes). Journal of applied Ichthyology, 29: 738-742. [DOI:10.1111/jai.12154]
8. Froese R., Pauly D. 2007. Platycephalidae. Available in www.FishBase.org.
9. Gao T.X., Ji D.P., Xiao Y.S., Xue T.Q., Yanagimoto T., Setoguma T. 2011. Description and DNA barcoding of a new Sillago species, Sillago sinica (Perciformes: Sillaginidae), from coastal waters of China. Zoological Studies, 50: 254-263.
10. Garcia S., Reset L.L. 1981. Life cycles, dynamics, exploitation and management of coastal penaeid shrimp stock. FAO Fishery Technical Report, 203, 0215. Rome, Italy. 215p.
11. Hebert P.D.N., Cywinska A., Ball S.L., Waard J.R. 2003. Biological identification through DNA barcodes. Proceedings of the Royal Society part B, Biological Sciences, 270: 313-321. [DOI:10.1098/rspb.2002.2218]
12. Hajibabaei M., Singer G.A.C., Hebert P.D.N., Hickey D.A. 2007. DNA barcoding: how it complements taxonomy, molecular phylogenetics and population genetics. Trends Genet, 23: 167-172. [DOI:10.1016/j.tig.2007.02.001]
13. Ivanova N.V., Zemlak T.S., Hanner R.H., Hebert P.D. 2007. Universal primer cocktails for fish DNA barcoding. Molecular Ecology Notes, 7: 544-548. [DOI:10.1111/j.1471-8286.2007.01748.x]
14. Imamura H. 2015: Taxonomic revision of the flathead fish genus Platycephalus Bloch, 1785 (Teleostei: Platycephalidae) from Australia, with description of a new species. Zootaxa, 3904 (2): 151-207. [DOI:10.11646/zootaxa.3904.2.1]
15. Klimova A., Phillips C.D., Fietz K., Olsen M.T., Harwood J., Amos W., Hoffman J.I. 2014. Global population structure and demographic history of the grey seal. Molecular Ecology, 23:3999-4017. [DOI:10.1111/mec.12850]
16. Knapp L.W. 1999. Platycephalidae. In: FAO species identification guide for fishery purposes. The living marine resources of the Western Central Pacific (eds. K.E. Carpenter and V.H. Niem), Volume 4.Bony Fishes Part 2 (Mugilidae to Carangidae), FAO, Rome, Italy. pp: 2385-2421.
17. King E.O., Ward M.K., Raney D.E. 1954. Two simple media for the demonstration of pyocyanin and fluorescin. Journal of Laboratory and Clinical Medicine, 44: 301-307. Masuda Y., Ozawa T., Onoue O., Hamada T. 2000. Age and growth of the fathead, Platycephalus indicus, from the coastal waters of west Kyushu, Japan. Fisheries Research, 46: 113-121. Mohammadi Kia D., Kamrani A., Taherizadeh M.R., Saghar N. 2012. A comparative study of some biological characteristics of tapeworm in the coastal waters of Bandar Abbas. Journal of Aquatic Ecology, 2 (3): 56-41. [DOI:10.1016/S0165-7836(00)00138-7]
18. Nakabo T. 2002. Fishes of Japan with Pictorial Keys to the Species, English edition: Tokai University Press, Tokyo, Japan. 1749p.
19. Pinera J.A., Blanco G., Vázquez E., Sánchez J.A. 2007. Genetic diversity of black spot seabream (Pagellus bogaraveo) populations Spanish Coasts: a preliminary study. Marine Biology, 151:2153-2158. [DOI:10.1007/s00227-007-0665-5]
20. Puckridge M., Andreakis N., Appleyard S.A., Ward R.D. 2013. Cryptic diversity in flathead fishes (Scorpaeniformes: Platycephalidae) across the indo-West Pacific uncovered by DNA barcoding. Molecular Ecology Resources, 13:32-42. [DOI:10.1111/1755-0998.12022]
21. Rozas J., Sanchez-DelBarrio J.C., Messeguer X., Rozas R. 2003. "DnaSP, DNA polymorphism analyses by the coalescent and other methods." Bioinformatics, 19(18):2496-2497 [DOI:10.1093/bioinformatics/btg359]
22. Qin Y., Song N., Zou J.W., Zhang Z.H., Cheng G.P., Gao T.X., Zhang X.M. 2013. A new record of a flathead fish (Teleostei: Platycephalidae) from China based on morphological characters and DNA barcoding. Chinese Journal of Oceanology and Limnology, 31(3):617-24. [DOI:10.1007/s00343-013-2186-z]
23. Shao K.T., Chen J.P. 1987. Fishes of the family Platycephalidae (Teleostei: Platycephaloidei) of Taiwan with descriptions of two new species. Bulletin of the Institute of Zoology, Academia Sinica, 26: 77-94.
24. Thompson J.D. Higgins, D.G., Gibson T.J. 1994. Clustal W improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, positions [DOI:10.1093/nar/22.22.4673]
25. specific gap penalties and weight matrix choice. Nucleic Acids Research, 22: 4673-4680.
26. Ward R.D., Hanner R., Hebert P.D.N. 2009. The campaign to DNA barcode all fishes, FISH-BOL. The Journal of Fish Biology, 74: 329-356. [DOI:10.1111/j.1095-8649.2008.02080.x]
27. Ward R.D., Zemlak T.S., Innes B.H., Last P.R., Herbert P.D.N. 2005. DNA barcoding Australia's fish species. Philosophical Transactions of the Royal Society, London Series B: Biological Sciences, 360(1462): 1847-1857. [DOI:10.1098/rstb.2005.1716]
28. Wang H., Kesinger J.W., Zhou Q., Matrin G., Turner S., 2008. Identification and characterization of zebra fish ocular formation genes. Genome, 51(3):222-235. [DOI:10.1139/G07-098]
29. Xiao J.G., Song N., GAO T.X., McKay R.J. 2016. Redescription and DNA barcoding of Sillago indica (Perciformes: Sillaginidae) from the coast of Pakistan. Pakistan Journal of Zoology, 48: 317-323.
30. Zemlak T.S., Ward R.D., Connell A.D., Holmes B.H., Hebert P.D.N. 2009. DNA barcoding reveals overlooked marine fishes. Molecular Ecology Resources, 9(Suppl-1): 237-242. [DOI:10.1111/j.1755-0998.2009.02649.x]
31. Zhang C., Cheng Q., Zheng B., Li S., Zheng W., Wang W. 1994. The fishes of the Yellow and Bohai Sea. The Sueichan Press, Keelung, Taiwan. pp: 255-256.
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Pourmozaffar S, Tamadoni Jahromi S, Gozari M, Foroughifard H, Amiz R. Molecular investigation and DNA Barcoding of Platycephalus indicus from the Persian Gulf. JAIR 2020; 8 (3) :19-26
URL: http://jair.gonbad.ac.ir/article-1-690-fa.html

پورمظفر سجاد، تمدنی جهرمی سعید، گذری محسن، فروغی فرد حجت الله، آمیز رقیه. بررسی ملکولی و DNA بارکدینگ ماهی زمین کن دم نواری (Platycephalus indicus) در سوحل خلیج فارس. نشریه علمی پژوهشی پژوهشهای ماهی شناسی کاربردی. 1399; 8 (3) :19-26

URL: http://jair.gonbad.ac.ir/article-1-690-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 8، شماره 3 - ( پاییز-99 1399 ) برگشت به فهرست نسخه ها
نشریه علمی پژوهشی پژوهشهای ماهی شناسی کاربردی Journal of Applied Ichthyological Research
Persian site map - English site map - Created in 0.1 seconds with 37 queries by YEKTAWEB 4692